Szkoła należy do Ogólnopolskiej Rodzin Szkół im. Jana Pawła II, stąd jej przedstawiciele uczestniczą w pielgrzymce szkół na Jasnej Górze. Ponadto uczniowie i nauczyciele biorą udział w wystawach i prelekcjach organizowanych przez dyrekcję Zamku Kmitów  i Lubomirskich w Nowym Wiśniczu, Muzeum Ziemi Wiśnickiej, Burmistrza Miasta Nowy Wiśnicz: „ Jan Paweł II w tajemnicy Fatimskiej” 2007, „Jan Paweł II Lourdes – Cierpienie i nadzieja” 2008, „Zostań z nami”, „W Jego świetle, w cieniu jego pomników” 2009, konkurs wiedzy poświęcony Janowi Pawłowi II 2010, „Śladami Papieża – ścieżka dydaktyczna poświęcona życiu i działalności Jana Pawła II”, montaż słowno – muzyczny przygotowany przez uczniów Zespołu Szkół im. Jana Pawła II 2011, „Od Polonii do Czarnej Madonny – modlitwa Jana Pawła II”, uroczysta lekcja wygłoszona przez prof. Czesława  Dźwigaja 2013, „Jan Paweł II papież Rodziny” wystawa na Zamku Kmitów i Lubomirskich pamiątek po Janie Pawle II, wystawa „Ślady pamięci ” w 34. rocznicę pontyfikatu, spektakl wystawiony przez dzieci i młodzież „Z zapisków Aniołów, czyli sceny z życia Jana Pawła II” 2012.

Corocznie reprezentacja szkoły uczestniczy w diecezjalnym Forum Rodziny Szkół im. Jana Pawła II w Gródku nad Dunajcem.     

Dzieci i młodzież włączają się w akcje charytatywne, do których inspiruje postawa patrona: zbiórka pieniędzy na operację 3 - miesięcznej mieszkanki Wiśnicza 2009, coroczna akcja „Góra grosza”, adopcja serca od grudnia 2012, szkoła adoptuje na odległość dziewczynkę Emmę Julię Gomes z Wysp Zielonego Przylądka, w adopcję włączyły  się dzieci, młodzież i grono pedagogiczne, „I Ty możesz zostać świętym Mikołajem”, pomoc dzieciom z bocheńskiego Domu Dziecka, „Sursum corda”, czyli udział uczniów w programie „Starszy brat – Starsza siostra”, Wielka Orkiestra Świątecznej Pomocy – powołanie wolontariuszy  i zbiórka pieniędzy w 2014 roku.

Swoje spotkania za patronem mają też dzieci w ramach edukacji wczesnoszkolnej. To m.in. konkursy wiedzy o  Janie Pawle II, konkursy plastyczne „Jan Paweł II przyjaciel dzieci”. Systematycznie urządza się wystawki klasowe książek o patronie, gazetki klasowe, gazetkę szkolną na korytarzu głównym, wyjazdy do kina na filmy o papieżu, zakup do biblioteki szkolnej filmów o Janie Pawle II.